熒光顯微鏡技術(shù)是目前在光鏡水平對特異卵白質(zhì)等生物大分子定性定位研究的非常有力工具之一。熒光顯微鏡技術(shù)主要是用于檢驗細(xì)胞上的特異熒光質(zhì)料，與普通光學(xué)顯微鏡不同的是熒光顯微鏡增長了兩套濾光片。一個稱為激發(fā)光濾片，裝在光源和樣品之間，只有那些能激發(fā)熒光質(zhì)料發(fā)光的特定波長的光才能通過。另外一個為阻斷濾片，裝在物鏡和目鏡之間，只讓燃料所發(fā)出的熒光通過。在黑暗背景的襯托下，發(fā)出熒光的樣品非常容易被調(diào)查。

熒光顯微鏡技術(shù)包括MIAN疫熒光技術(shù)和熒光素直接標(biāo)志技術(shù)。例如，將標(biāo)志熒光素的純化肌動卵白顯微注射入培養(yǎng)細(xì)胞中，可以看到肌動卵白分子組裝成肌動卵白纖維。可將產(chǎn)生熒光的綠色熒光卵白基因與某種卵白質(zhì)基因配備，在表白這種配備卵白的細(xì)胞中，便可直接在活體狀況下調(diào)查到該卵白在活細(xì)胞內(nèi)的動態(tài)變化。不同熒光素的激發(fā)波長局限不同，所以同一樣品可以用兩種以上的熒光素標(biāo)志，同時顯示不同成分在細(xì)胞中的定位。